Différence entre Exome et Transcriptome

Différence clé - Exome vs Transcriptome

Un gène contient des régions codantes et non codantes. Les séquences de codage sont appelées exons, et les séquences non codantes sont appelées introns. La séquence nucléotidique des exons d'un gène représente le code génétique du gène pour synthétiser la protéine spécifique. Par conséquent, les exons restent dans la molécule d'ARNm. La région exon totale du génome est connue sous le nom d'exome, et c'est une partie importante du génome. Le code génétique des gènes est converti en code génétique de la molécule d'ARNm, nécessaire à la production de protéines. L'ensemble des molécules d'ARNm transcrites dans une cellule ou une population cellulaire à la fois est connu sous le nom de transcriptome. La différence essentielle entre l'exome et le transcriptome est que

exome représente les séquences des régions exon du génome alors que le transcriptome représente l'ARNm total d'une cellule ou d'un tissu à un moment donné.

TABLE DES MATIÈRES

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que Exome
3. Qu'est-ce que Transcriptome
4. Comparaison côte à côte - Exome vs Transcriptome
5. Résumé
Qu'est-ce que Exome?

Les gènes sont composés d'exons, d'introns et de séquences régulatrices. Les exons sont les régions du gène qui sont transcrites dans la séquence d'ARNm pendant la transcription. Les introns et d'autres régions non codantes sont éliminés au cours de la transcription. La séquence nucléotidique des exons détermine le code génétique du gène qui synthétise la protéine spécifique qu'il code. Seuls les exons restent dans l'ARNm d'une protéine. La collection d'exons dans le génome est connue comme exome d'un organisme. Il représente une partie du génome qui s'exprime dans les gènes. Chez l'homme, l'exome représente 1% du génome. C'est la partie codant pour les protéines du génome humain.

Figure 01: Exome

Qu'est-ce que le transcriptome?

Le transcriptome est la collection de tous les transcrits (ARN) codant des protéines et non codant dans un tissu donné. Le transcriptome représente la collection de molécules d'ARNm totales exprimées par les gènes dans une cellule ou un tissu. Le transcriptome d'une cellule peut être modifié avec le transcriptome d'un autre type cellulaire. Le transcriptome est également dynamique - il évolue avec le temps en réponse à des stimuli internes et externes. Même dans le même tissu ou dans le même type de cellule, le transcriptome peut changer après quelques minutes.

Le transcriptome diffère de l'exome d'un organisme. Le transcriptome comprend seulement les séquences exprimées d'exome.Bien que l'exome d'une cellule reste le même, le transcriptome diffère entre les cellules puisque l'expression des gènes n'est pas la même pour toutes les cellules ou tissus. Seuls les gènes essentiels sont exprimés dans différentes cellules et tissus. L'expression génique est un processus spécifique de type tissulaire ou cellulaire. Il est réglementé par divers facteurs, y compris des facteurs environnementaux. Par conséquent, le transcriptome peut varier selon les conditions environnementales externes.

Le transcriptome est utilisé comme précurseur pour les études de protéomique. Toutes les protéines sont dérivées de séquences d'ARNm. Les modifications translationnelles peuvent entraîner des changements dans les protéines. Cependant, le transcriptome fournit des informations de base importantes pour les études protéomiques.

Figure 02: Transcriptome de cellules souches embryonnaires

Quelle est la différence entre Exome et Transcriptome?

Exome vs Transcriptome

Exome est la collection de la région codant pour les protéines des gènes.

Le transcriptome est la collection de tous les ARN transcrits incluant l'ARNm. Echantillon
L'exome est étudié à l'aide d'un échantillon d'ADN.
Le transcriptome est étudié en utilisant un échantillon d'ARN. Méthode d'étude
Le séquençage complet de l'exome est la méthode d'étude de l'exome.
Le séquençage de l'ARN est la méthode d'étude du transcriptome. Résumé - Exome vs Transcriptome

Les exons sont les séquences codantes des gènes et déterminent les séquences d'ARNm des protéines. La collection de ces séquences codantes (exons) est connue sous le nom d'exome d'un organisme. Les gènes sont transcrits en molécules d'ARNm avant de fabriquer des protéines. Les molécules d'ARNm total d'une cellule ou d'un tissu à un moment donné sont connues sous le nom de transcriptome. Le transcriptome représente les gènes qui sont activement exprimés dans l'ARNm à un moment donné. Le transcriptome est spécifique aux cellules et aux tissus et affecte les conditions environnementales. C'est la différence entre exome et transcriptome.

Références:

1. Sarah et al, "Capture ciblée et séquençage massivement parallèle de douze exomes humains. " La nature. U. S. Bibliothèque nationale de médecine, 10 septembre 2009. Web. 01 avr. 2017
2. Mutz et al. "Analyse transcriptome utilisant le séquençage de nouvelle génération. "Elsevier: Localisateur d'articles. N. p. , Septembre 2012. Web. 01 avr. 2017
Courtoisie d'image:

1. "Le transcriptome des cellules pluripotentes" Par Grskovic, M. et Ramalho-Santos, M., Le transcriptome pluripotent (10 octobre 2008), StemBook, ed. La communauté de recherche sur les cellules souches, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, // www. stembook. org. - [1] DirectStemBook Figure 2 Le transcriptome des cellules pluripotentes. Grskovic, M. et Ramalho-Santos, M., Le transcriptome pluripotent (10 octobre 2008), StemBook, éd. La communauté de recherche sur les cellules souches, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, (CC BY 3. 0) via Commons Wikimedia