Différence entre réparation d'excision de base et réparation d'excision de nucléotide | BER vs NER

L'ADN est fréquemment soumis à des dommages dus à divers facteurs internes et externes. Cependant, les systèmes de réparation cellulaire corrigent immédiatement et constamment les dommages avant qu'ils ne deviennent des mutations ou avant qu'ils ne soient transférés aux générations suivantes. Il existe trois types de systèmes de réparation d'excision dans les cellules: la réparation par excision de nucléotides (NER), la réparation par excision de base (BER) et la réparation par mésappariement d'ADN (ROR) pour réparer les dommages à l'ADN simple brin. La principale différence entre la réparation d'excision de base et la réparation d'excision de nucléotide est que la réparation d'excision de base est un système de réparation simple qui fonctionne dans les cellules pour réparer les dommages nucléotidiques uniques causés de façon endogène

et système qui fonctionne dans les cellules pour réparer des régions relativement plus grandes et endommagées causées de manière exogène. TABLE DES MATIÈRES

1. Vue d'ensemble et différence clé

2. Qu'est-ce que la Réparation Excision de Base

3. Qu'est-ce que la réparation d'excision de nucléotide

4. Comparaison côte à côte - Réparation d'excision de base vs Réparation d'excision de nucléotide

5. Résumé

Qu'est-ce que la réparation d'excision de base?

La réparation par excision de base est la version la plus simple du système de réparation de l'ADN que possèdent les cellules. Il est utilisé pour réparer des dommages mineurs dans l'ADN. Les bases d'ADN sont modifiées en raison de la désamination ou de l'alkylation. Lorsqu'il y a des dommages de base, l'ADN glycosylase reconnaît et active le système de réparation d'excision de base et le récupère à l'aide d'enzymes AP endonucléase, ADN polymérase et ADN ligase. Les étapes suivantes sont impliquées dans le système BER.

- Reconnaissance et élimination d'une base incorrecte ou endommagée par une ADN glycosylase pour créer un site abasique (sites de perte de base - sites apiiminiques ou apyrimidiniques).

Incision du site abasique par une endonucléase apurinique / apyrimidinique

Elimination du reste du fragment de sucre par une lyase ou une phosphodiestérase

1. Remplissage par une ADN polymérase
2. Obturation de la coupure par une ADN ligase
3. ! -> -
4. Figure 01: Voie de réparation d'excision de base
5. Qu'est-ce que la réparation d'excision de nucléotide?

Nucleotide Excision Repair (NER) est un important système de réparation d'excision de l'ADN dans les cellules. Il est capable de réparer et de remplacer les régions endommagées jusqu'à 30 bases de longueur et il est dirigé par le brin de modèle intact.Les dommages à l'ADN sont fréquents en raison du rayonnement ultraviolet et le NER protège l'ADN en réparant ces dommages immédiatement avant de devenir des mutations et de passer aux générations futures ou de causer des maladies. NER fournit spécifiquement une protection contre les mutations causées indirectement par des facteurs exogènes tels que les cancérogènes environnementaux et chimiques. Le NER est observé dans presque tous les organismes, et il reconnaît les dommages qui causent une distorsion importante dans l'hélice d'ADN.

Le processus NER implique l'action de plusieurs protéines telles que XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, etc. Ces protéines sont essentielles à l'achèvement du processus de réparation et un défaut de l'une des protéines NER est vital et peut provoquer de rares syndromes récessifs: xeroderma pigmentosum (XP), syndrome de Cockayne et la forme photosensible du trouble des cheveux cassants trichothiodystrophie (TTD).

Figure 02: Réparation d'excision de nucléotide

Quelle est la différence entre la réparation d'excision de base et la réparation d'excision de nucléotide?

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Réparation d'excision de base vs réparation d'excision de nucléotide

La réparation d'excision de base (BER) est un système de réparation d'ADN qui se produit dans les cellules.

La réparation d'excision de nucléotide (NER) est un autre type de système de réparation de l'ADN trouvé dans les cellules.

Reconnaissance des adduits d'ADN
Le BER répare les dommages aux petits adduits d'ADN.	Le NER répare de grands adduits d'ADN.
DNA Damages
Le BER reconnaît les dommages qui ne causent pas de distorsions significatives à l'hélice d'ADN.	Le NER reconnaît les dommages qui causent des distorsions importantes à l'hélice d'ADN.
Causes des dommages causés à l'ADN
Le BER répare les dommages causés par les mutagènes endogènes.	Le NER répare les dommages causés par les mutagènes exogènes.
Complexité
Le BER est le système de réparation le moins complexe	C'est plus complexe que le BER.
Besoin de protéines
Le BER ne nécessite pas d'autres protéines.	Le NER nécessite plusieurs produits de gènes, en particulier des protéines, pour distinguer les régions endommagées et non endommagées.
Adéquation
Le BER est adapté pour corriger les dommages de base unique.	NER est adapté pour remplacer les régions endommagées.
Résumé - La réparation d'excision de base vs la réparation d'excision de nucléotide
NER et BER sont deux types de processus de réparation d'excision d'ADN trouvés dans les cellules. BER est capable de réparer de petits dommages causés de manière endogène, alors que le NER est capable de réparer des régions endommagées jusqu'à 30 paires de bases de longueur causées principalement par des processus exogènes. BER diffère du NER dans les types de substrats reconnus et dans l'événement de clivage initial. Le BER peut également reconnaître des dommages qui n'ont pas été causés par des distorsions significatives dans l'hélice d'ADN alors que le NER reconnaît des distorsions significatives de l'hélice d'ADN. C'est la différence entre la réparation de l'excision de base et l'excision des nucléotides.	Courtoisie d'image:

1. "Dna repair base excersion fr" Par LadyofHats - (Domaine Public) via Commons Wikimedia

2. «Une représentation schématique de modèles pour la voie de réparation de l'excision des nucléotides contrôlée par les protéines Uvr» par Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui et Seiki Kuramitsu. CC BY 1.0) via Commons Wikimedia

Références:

1. Kim, Yun-Jeong et David M. Wilson. "Vue d'ensemble de la biochimie de réparation d'excision de base. "La pharmacologie moléculaire actuelle. U. S. Bibliothèque nationale de médecine, janv. 2012. Web. 14 mars 2017.

2. Boer, Jan De et Jan H. J. Hoeijmakers. "Réparation d'excision de nucléotide et syndromes humains. "Carcinogenèse. Oxford University Press, 01 mars 2000. Web. 28 mars 2017

3. Hoogstraten et al. "La détection polyvalente de dommages à l'ADN par la protéine de réparation de l'excision du génome du génome global XPC. "Journal of Cell Science. The Company of Biologists Ltd, 01 sept. 2008. Web. 28 mars 2017