Différence entre le génotypage et le séquençage | Génotypage vs séquençage

Différence clé - Génotypage vs séquençage

Le génotypage et le séquençage sont deux techniques utilisées pour obtenir des informations sur les acides nucléiques, principalement l'ADN d'un organisme. La principale différence entre le génotypage et le séquençage est que le génotypage est le processus de détermination de la variante génétique que l'individu possède en utilisant des marqueurs tandis que le séquençage est la détermination de l'ordre correct de la séquence nucléotidique dans le fragment d'ADN donné.

TABLE DES MATIÈRES

1. Vue d'ensemble et différence clé

2. Qu'est-ce que le génotypage

3. Qu'est-ce que le séquençage

4. Comparaison côte à côte - Génotypage vs séquençage

5. Résumé

Qu'est-ce que le génotypage?

Le génotypage est la détermination de la constitution génétique d'un individu en utilisant une séquence d'ADN et de marqueurs et la comparaison et l'identification de son héritage. Le génotypage est important en biologie évolutive, en biologie des populations, en taxonomie, en écologie et en génétique des organismes. Il peut être effectué par différentes techniques, y compris le séquençage de l'ADN, la réaction en chaîne de la polymérase, le polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP), la détection polymorphe amplifiée au hasard, le polymorphisme amplifié des fragments de longueur (AFLP), les puces à ADN, etc.

Le génotypage implique le séquençage de petits fragments particuliers de séquences d'ADN et la découverte de la parenté de la composition génétique avec d'autres individus à l'aide de marqueurs génétiques. Il détermine les polymorphismes mononucléotidiques (SNP) entre les individus ou les allèles spécifiques. Le génotypage est applicable à un large éventail d'organismes, y compris les humains. Il est également applicable aux micro-organismes tels que les virus, les champignons, etc. et peut être utilisé pour déterminer leurs variantes génétiques avec les profils de référence. En épidémiologie moléculaire et en microbiologie médico-légale, la maîtrise des agents pathogènes, en particulier des microorganismes, est assurée par l'information obtenue par le génotypage. Le génotypage est très important dans l'analyse généalogique. Les humains sont génotypés pour confirmer la maternité et la paternité. Génotype va révéler les allèles dominants et récessifs des gènes qui décident de traits spécifiques.

Figure_1: Génotypage RFLP

Qu'est-ce que le séquençage?

Le séquençage est le processus de détermination de l'ordre correct du nucléotide dans un fragment donné d'ADN ou d'ARN. Pratiquement toutes les informations requises pour la croissance et le développement d'un organisme sont codées dans son génome. La disponibilité de techniques pour produire et séparer des fragments d'acides nucléiques de quelques centaines de nucléotides a conduit au développement de procédures de détermination de la séquence nucléotidique exacte d'un fragment donné d'ADN ou d'ARN.Différents types de méthodes de séquençage sont disponibles aujourd'hui. Ces méthodes de séquençage, associées aux technologies de construction de banques de génomes représentant l'ensemble du génome d'un organisme, facilitent le séquençage de l'ensemble du génome de cet organisme, en analysant en profondeur les structures géniques, les fonctions géniques, l'emplacement des gènes, la cartographie des gènes, les régions régulatrices des gènes, etc.

Les génomes totaux de plusieurs virus, plusieurs bactéries, archaebactéries, levures et plusieurs autres organismes ont été séquencés et cartographiés. Le projet sur le génome humain a permis de séquencer et de cartographier l'ensemble du génome humain et de publier son premier projet en 2003. Il s'agit d'une étape majeure dans l'avancement de la biologie. Les séquences du génome humain sont maintenant utilisées dans le secteur médical pour identifier les causes génétiques des maladies rares, détecter les risques de maladie chez les nouveau-nés, identifier les détails génétiques des différents cancers, développer de nouveaux traitements, développer de nouveaux outils de diagnostic, etc.

, le génome du riz et les génomes d'Arabidopsis ont été séquencés. La connaissance de ces séquences va sans aucun doute révolutionner notre compréhension du fonctionnement des cellules et des organismes.

Figure_2: Autoradiographie du séquençage de Sanger

Quelle est la différence entre le génotypage et le séquençage?

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Génotypage vs séquençage

Le génotypage est le processus de détermination de la composition génétique d'un individu et de vérification du groupe ou de la taxonomie de cet organisme.

Le séquençage est le processus de détermination de l'ordre précis des nucléotides d'un fragment d'ADN ou d'ARN donné.
Techniques	RFLP, séquençage génique, PCR, puces à ADN, AFLP, etc.
Séquençage Sanger, séquençage Gilbert, pyroséquençage, séquençage Next Generation, séquençage Shotgun etc.
Préoccupations majeures	préoccupé par la question de savoir si les différences de génotype donnent les différences phénotypiques réelles.
Ceci est plus préoccupé par l'ordre des nucléotides et ses différences et changements avec d'autres organismes.
Résumé - Génotypage vs séquençage	Le génotypage et le séquençage sont utiles pour étudier l'information génétique des organismes. Le génotypage est le processus de détermination des variations de génotype entre les individus et de trouver leurs catégories. Le séquençage est le processus de détermination de l'ordre correct des nucléotides dans le fragment intéressé ou la région de l'ADN. Les deux techniques fournissent des informations importantes sur les gènes et les génomes.

Référence:

1. "Méthodes de génotypage. "Méthodes en biologie moléculaire (Clifton, N. J.). U. S. Bibliothèque nationale de médecine, n. ré. Web. 20 février 2017.

2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin et M. D. Shriver. "Analyse de la courbe de fusion des SNP (McSNP ): une approche sans gel et peu coûteuse pour le génotypage SNP. "BioTechniques 30. 2 (2001): 358-67. Web.

Courtoisie d'image:

1. "Génotypage RFLP" Par (inconnu) - Instituts nationaux de la santé (domaine public) via Commons Wikimedia

2."Radioactive Fluorescent" Par Abizar sur Wikipedia anglais (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia