Différence entre VNTR et STR | VNTR vs STR

Anonim

Différence clé - VNTR vs STR

Les études d'ADN ont une immense utilité pour comprendre et déterminer les relations phylogénétiques, diagnostiquer les maladies génétiques et cartographier les génomes de l'organisme. Plusieurs techniques associées à l'analyse de l'ADN sont utilisées pour l'identification d'un gène particulier ou d'une séquence d'ADN dans un pool d'ADN inconnu. Ils sont connus comme marqueurs génétiques. Les marqueurs génétiques sont utilisés en biologie moléculaire pour identifier la variation génétique entre les individus et les espèces. La répétition en tandem à nombre variable (VNTR) et la répétition en tandem courte (STR) sont deux types de marqueurs génétiques qui présentent un polymorphisme chez les individus. Les deux types sont des ADN répétitifs non codants qui sont des répétitions en tandem. Ils sont disposés en tête-à-queue dans les chromosomes. VNTR est une section du génome où la séquence nucléotidique courte est répétée plusieurs fois. STR est une autre section de l'ADN dans le génome qui est organisée en unités répétitives constituées de deux à treize nucléotides à cent fois. La différence clé entre VNTR et STR est le nombre de nucléotides dans une séquence répétitive. Les unités répétitives de VNTR se composent de 10 à 100 nucléotides tandis que l'unité répétitive de STR comprend de 2 à 13 nucléotides . VNTR et STR sont largement utilisés dans les études médico-légales.

TABLE DES MATIÈRES

1. Vue d'ensemble et différence clé

2. Qu'est-ce que VNTR

3. Qu'est-ce que STR

4. Similitudes entre VNTR et STR

5. Comparaison côte à côte - VNTR vs STR sous forme tabulaire

6. Résumé

Qu'est-ce que VNTR?

Une répétition en tandem est une courte séquence d'ADN qui se répète de tête en queue à un locus chromosomique spécifique. Il n'y a pas d'autre séquence ou nucléotide dans la répétition en tandem. Il existe plusieurs types de répétitions en tandem dans le génome. VNTR est un type de répétition en tandem parmi eux qui a des unités répétées constituées de 10 à 100 nucléotides. VNTR est un type de minisatellite. Ces répétitions en tandem peuvent être trouvés dans de nombreux chromosomes. Ils sont intercalés dans le génome humain et sont situés principalement dans les régions subtélomériques des chromosomes.

Les VNTRs montrent le polymorphisme de répétition en tandem chez les individus. La longueur du VNTR à un endroit particulier du chromosome est très variable chez les individus en raison de la variation du nombre d'unités récurrentes organisées dans cette section d'ADN. Par conséquent, VNTR peut être utilisé comme un outil puissant dans l'identification des individus et l'analyse VNTR est utilisée dans de nombreux domaines, y compris la génétique, la recherche en biologie, la médecine légale et l'empreinte digitale.Les VNTR étaient les premiers marqueurs génétiques utilisés pour quantifier la greffe de greffe de moelle osseuse. Les VNTR étaient également les premiers marqueurs polymorphiques utilisés dans le profilage de l'ADN en médecine légale.

Figure 01: Variation des VNTR chez six individus

L'analyse VNTR est réalisée par polymorphisme de longueur des fragments de restriction suivie d'une hybridation par le sud. Par conséquent, il a besoin comparativement d'un grand échantillon d'ADN. L'interprétation du profil VNTR est également problématique. En raison de ces limitations, l'utilisation de VNTR en génétique médico-légale a été limitée et remplacée par l'analyse STR.

Qu'est-ce que STR?

STR est une section d'ADN hautement répétitive qui consiste en deux à treize unités répétitives nucléotidiques organisées de manière tandem. STR est similaire à VNTR. Mais il varie de VNTR à partir du nombre de nucléotides dans une séquence répétitive et le nombre de répétitions. STR est un type de microsatellite.

Analyse STR utilisée pour mesurer le nombre exact d'unités récurrentes. Les DOS sont très variables chez les individus, similaires aux VNT. Les profils STR diffèrent d'une personne à l'autre. Par conséquent, l'analyse STR est utilisée en biologie moléculaire pour comparer des loci spécifiques sur l'ADN de deux échantillons ou plus. Les STR sont donc considérées comme des marqueurs génétiques puissants en biologie moléculaire. Il fournit un excellent outil pour l'identification des individus en raison de leur degré élevé de polymorphisme et de leur longueur relativement courte.

À l'heure actuelle, les STR sont l'outil de polymorphisme génétique analysé le plus couramment utilisé en génétique médico-légale. La plupart des cas médico-légaux impliquent l'analyse polymorphique STR. Les locus STR sont répartis dans le génome. Il existe des milliers de STR situés dans les chromosomes qui peuvent être utilisés dans l'analyse médico-légale. L'analyse STR n'implique pas de polymorphisme de longueur de restriction comme l'analyse VNTR. L'analyse STR ne coupe pas l'ADN avec des enzymes de restriction. Des sondes spécifiques sont utilisées pour fixer les régions désirées sur l'ADN et en utilisant la technique de PCR, les longueurs de la STR sont déterminées.

Figure 02: Variation STR entre les échantillons

Quelles sont les similitudes entre VNTR et STR?

VNTR et STR sont des ADN non codants.

  • Les deux sont des répétitions en tandem.
  • Les deux présentent un polymorphisme chez les individus en raison de la différence de longueur de la section d'ADN.
  • Les deux sont utilisés comme marqueurs génétiques puissants dans l'empreinte d'ADN et dans les études médico-légales.
  • Quelle est la différence entre VNTR et STR?

- diff Article Milieu avant Table ->

VNTR vs STR

VNTR est un ADN répétitif non codant qui a une courte séquence nucléotidique répétée de manière tandem.

STR est une section d'ADN hautement répétitive qui consiste en deux à treize unités répétitives nucléotidiques organisées de manière tandem. Taille
Les VNTR sont plus grands que les DOD.
Les DOS sont plus petites que les VNTR. Nombre de nucléotides dans la séquence de répétition
L'unité récurrente de VNTR se compose de 10 à 100 nucléotides.
L'unité récurrente de STR comprend de 2 à 13 nucléotides. Résumé - VNTR et STR

VNTR et STR sont deux puissants marqueurs génétiques utilisés en biologie moléculaire, en particulier dans le domaine de la génétique légale.VNTR est un type de minisatellite et STR est un microsatellite. VNTR et STR sont des ADN non codants et hautement répétitifs. Ce sont des répétitions en tandem. La structure générale de VNTR et STR sont les mêmes. Cependant, le nombre de nucléotides dans la séquence répétitive et la longueur sont différents. VNTR a des séquences répétitives composées de 10 à 100 nucléotides. STR a des séquences répétées constituées de 2 à 13 nucléotides. C'est la différence entre VNTR et STR.

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Références:

1. "La science de la génétique médico-légale. "CRG - Conseil pour la génétique responsable. N. p., n. ré. Web. Disponible ici. 10 juillet 2017.

2. "Analyse STR. " Wikipédia. Fondation Wikimedia, 22 mars 2017. Web. Disponible ici. 10 juillet 2017.

Courtoisie d'image:

1. "D1S80Demo" Par PaleWhaleGail sur Wikipedia anglais (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia