Différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique | ADNc vs banque d'ADN génomique
Différence clé - ADNc vs bibliothèque génomique
Il existe deux grands types de bibliothèques d'ADN construits par des scientifiques utilisant des techniques de génie génétique. Ceux-ci sont la bibliothèque d'ADNc et la bibliothèque génomique. La différence clé entre l'ADNc et la banque génomique est que la banque d'ADNc contient l'ADN complémentaire clone de l'ARNm total d'un organisme tandis que la banque d'ADN génomique contient les fragments clonés du génome entier d'un organisme. La banque d'ADN génomique est plus grande que la banque d'ADNc.
TABLE DES MATIÈRES
1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que la bibliothèque d'ADNc
3. Qu'est-ce que la bibliothèque génomique
4. Comparaison côte à côte - ADNc vs bibliothèque génomique
5. Résumé
Qu'est-ce qu'une bibliothèque génomique?
Une banque d'ADN génomique est une collection de clones portant les fragments de l'ADN génomique total d'un organisme. Il contient l'ensemble de l'ADN génomique de cet organisme, y compris les séquences codantes et non codantes. La construction d'une banque génomique est réalisée par la technologie de l'ADN recombinant suivie du clonage (génie génétique). Il y a différentes étapes impliquées dans la construction, comme le montre la figure 01. Le processus commence par l'isolement de l'ADN génomique. En utilisant un protocole d'extraction d'ADN approprié, l'ADN génomique total d'un organisme doit être isolé. Ensuite, l'ADN doit être converti en tailles gérables ou en fragments spécifiques par des endonucléases de restriction (enzymes de coupe d'ADN). L'ADN fragmenté doit être inséré dans des vecteurs en utilisant des ADN ligases (enzymes d'assemblage de l'ADN). Un vecteur est un organisme auto-répliquant. Les plasmides et les bactériophages sont des vecteurs couramment utilisés dans la technologie de l'ADN recombinant. Ces vecteurs ligaturés sont connus sous le nom de molécules d'ADN recombinant puisqu'ils portent à la fois des séquences d'ADN propres et insérées. Des vecteurs recombinants sont ajoutés à une bactérie hôte et amenés à absorber les vecteurs recombinants à l'intérieur de la cellule bactérienne. Les bactéries avec des vecteurs recombinants (plasmides) doivent être cultivées dans un milieu de culture. Pendant la multiplication bactérienne, l'ADN bactérien, ainsi que les plasmides recombinants, répliquent leurs génomes et produisent des clones. Ces clones contiennent l'ensemble du génome de l'organisme source. Par conséquent, il est appelé une bibliothèque génomique. Les plasmides peuvent facilement être séparés de l'ADN chromosomique bactérien pour construire la banque génomique de cet organisme. Si un organisme particulier contient des gènes intéressés, il est facile de le détecter dans la bibliothèque génomique par hybridation en utilisant des sondes moléculaires (marqueurs).
Les bibliothèques génomiques sont importantes pour étudier la structure et la fonction génomique, les gènes spécifiques, la localisation des gènes, la cartographie des gènes, les mutations, le séquençage des gènes, l'identification de nouveaux gènes thérapeutiques, etc.Figure_1: Construction d'un bibliothèque génomique
Une bibliothèque d'ADNc est une collection de clones d'ADN complémentaire (ADNc) synthétisés à partir de l'ARNm total d'un organisme. La procédure de construction implique différentes étapes. La purification de l'ARNm total d'un organisme est la première étape impliquée. Les ARNm isolés sont convertis en brins d'ADNc par un processus appelé transcription inverse. La transcription inverse est facilitée par une enzyme appelée transcriptase inverse. Il utilise une petite amorce en 3 'et initie la synthèse du premier brin d'ADNc complémentaire du brin matrice de l'ARNm. L'ADNc double brin résultant est converti en fragments plus petits en utilisant des endonucléases de restriction et inséré dans des vecteurs appropriés. Ces molécules recombinantes construites sont ensuite ajoutées dans un organisme hôte et cultivées dans un milieu de culture pour produire des clones. La collection de clones contenant des fragments d'ADNc d'un organisme est connue sous le nom de bibliothèque d'ADNc. L'ARNm mature entièrement tranché ne contient pas d'introns ni de régions régulatrices. Par conséquent, les fragments non codants ne sont pas présents dans les banques d'ADNc contrairement à une banque génomique.
Les banques d'ADNc sont importantes pour l'analyse des régions codantes, des fonctions géniques, de l'expression des gènes, etc.
Figure_2: Construction d'une bibliothèque d'ADNc
Quelle est la différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique?
- diff Article Milieu avant Table ->
ADNc vs bibliothèque génomique
La bibliothèque d'ADNc est une collection des clones portant l'ADN complémentaire à l'ARNm d'un organisme |
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| La bibliothèque génomique est une collection de clones portant l'ADN génomique total d'un organisme. | La bibliothèque d'ADNc de Codage vs Noncoding Sequences |
| contient seulement les séquences codantes; il ne contient pas d'introns. | |
| La bibliothèque génomique est constituée de l'ensemble de l'ADN génomique incluant l'ADN non codant (introns et régulateurs). | La taille |
| bibliothèque d'ADNc est petite. | |
| La bibliothèque génomique est grande. | Matériau de départ |
| Le matériau de départ est l'ARNm | |
| Le matériau de départ est l'ADN. | Implication de la transcription inverse. |
| La transcription inverse se produit dans la première synthèse des brins d'ADNc. | |
| La transcription inverse ne se produit pas. | Résumé - ADNc et bibliothèque génomique |
La banque génomique représente une population de clones portant l'ADN génomique total fragmenté d'un organisme. La banque d'ADNc représente la population de clones portant un ADN complémentaire de l'ARNm total d'un organisme. Un clone d'ADNc contient seulement les séquences trouvées dans l'ARNm tandis que le clone génomique contient les séquences de l'ensemble du génome. C'est la différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique.
Référence:
1. Haneef, Deena T KochunniJazir. "Différence entre la bibliothèque génomique et l'ADNc. "Différence entre la bibliothèque génomique et l'ADNc. N. p., n. ré. Web. 15 févr.2017
2. Stekel, Dov J., Yoav Git et Francesco Falciani. "La comparaison de l'expression génique de plusieurs banques d'ADNc. "Recherche sur le génome. Cold Spring Harbor Laboratory Press, décembre 2000. Web. 16 févr. 2017
3. "Les écrans de la banque génomique pour les gènes impliqués dans la tolérance au n-butanol chez Escherichia coli. "Les écrans de la banque génomique pour les gènes impliqués dans la tolérance au n-butanol chez Escherichia coli. N. p., n. ré. Web. 16 févr. 2017
Courtoisie d'image:
1. "Formation d'une bibliothèque d'ADNc" Par PhD Dre sur Wikipédia en anglais (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia
2. "Construction de la bibliothèque génomique" Par Aluquette - Propre travail (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia
